期刊简介

               本刊作为汉语世界中唯一的动脉硬化性疾病专业期刊,主要报道生物医学中防治动脉硬化性疾病(如高脂血症、动脉粥样硬化、冠状动脉疾病、缺血性脑血管疾病、高血压和其它动脉硬化症等)和血管生物的学术研究论文、诊治经验和典型病例等。其办刊宗旨是:通过报道防治动脉硬化性疾病的新理论、新观点、新疗法、新药物;介绍防治的新经验和新知识;既引导和弘扬我国的学术研究,促进国内外学术交流,将我国动脉硬化性疾病的研究推向世界和未来,将国外的创新研究成果和先进的经验介绍给国内同仁,不断提高这一研究领域的学术水平。又普及防治知识,宣传科学饮食和合理营养,倡导文明的生活方式,预防动脉硬化性疾病,提高全民的生活质量和健康水平。主要读者对象是:中高等医药卫生院校师生、各级各类医院的医药卫生技术人员、具有高中以上文化程度的中老年人。                

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  • 杂志名称:中国动脉硬化杂志
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国病理生理学会 南华大学
  • 国际刊号:1007-3949
  • 国内刊号:43-1262/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:美国CA千种表期刊期刊收录:国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, CA 化学文摘(美), 万方收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
中国动脉硬化杂志2004年第01期

一个新的人突触相关蛋白基因的生物信息学分析

杨向东;王仁;刘俊文;唐蔚青;李红霞;王抒

关键词:病理学与病理生理学, 人突触相关蛋白基因, 生物信息学分析
摘要:目的运用抑制消减杂交(SSH)已从氧化型低密度脂蛋白处理的单核细胞源性泡沫化细胞中克隆差异表达基因,其中两个基因片段FRG4和FRG14经BLAST检索无同源序列,Genbank登录号为:FRG4[A BI 502586]和FRG14[Accession BI 502587].通过基于文库cDNA基础热启动PCR快速扩增cDNA末端技术,获得FRG4全长cDNA序列.有关该基因编码蛋白的研究很少,与脂蛋白代谢和泡沫细胞形成、凋亡的关系没有报道.本文利用生物信息学技术对此进行研究,为进一步深入研究其表达和功能奠定基础.方法与结果利用生物信息学软件通过互联网上核酸和蛋白质数据库.对泡沫化相关基因FRG4进行基因组分析、染色体定位分析、理化特性分析、细胞内定位分析和功能结构域预测.发现FRG4的开放阅读框(ORF)是从第62个碱基到第1120个碱基,编码352个氨基酸:FRG4编码的氨基酸序列与人类的突触相关蛋白(Homo sapiens synapse associated protein 1, SYAP1)有高度同源性(99%);FRG4的染色体定位分析显示定位在X染色体的短臂2区2带2亚带2次亚带;根据内含子、外显子剪切规律分析,FRG4基因由9个外显子、8个内含子组成;人FRG4蛋白质氨基酸序序列与小鼠、果蝇的氨基酸序列进行多序列同源性比较,一致率分别为70%和58%,预测FRG4蛋白的结构域,显示该蛋白序列中有一结构域BSD,包含一特异性模序(FW-motif),它是真核转录因子家族的成员;利用BIOEDIT软件对FRG4蛋白的亲疏水性分析,结果显示FRG4无疏水性区,可能为一水溶性蛋白;利用ExPASy软件分析该蛋白分子质量为40 kDa,等电点(pI)为4.45,为一略酸性蛋白;利用PsortⅡ软件分析该蛋白的亚细胞定位,结果显示该蛋白定位于细胞质的可能性较大(52.2%:cytoplasmic).结论泡沫化细胞差异表达基因FRG4经生物信息学分析,与人突触相关蛋白基因有很高同源性,它编码的蛋白可能为一水溶性蛋白,分子质量为40 kDa,定位于细胞质,属于真核转录因子家庭.